Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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