Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sycp3P70281 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms