Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf6P70279 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms