Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms