Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sumo1P63166 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms