Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga11P61622 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms