Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf13P61216 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Taf13P61216 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf13P61216 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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