Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snap25P60879 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap25P60879 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms