Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ActbP60710 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ActbP60710 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ActbP60710 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms