Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms