Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpa1P57784 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms