Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms