Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lim2P56563 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lim2P56563 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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