Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms