Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp1P55194 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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