Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcd3P55096 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd3P55096 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms