Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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