Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Aff3P51827 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff3P51827 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms