Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr5P51682 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms