Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa10P50708 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa10P50708 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms