Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FmodP50608 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FmodP50608 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms