Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CitP49025 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CitP49025 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms