Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms