Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Epb41P48193 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Epb41P48193 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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