Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SrprbP47758 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SrprbP47758 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SrprbP47758 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SrprbP47758 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SrprbP47758 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SrprbP47758 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrprbP47758 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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