Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkx1-2P42580 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms