Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LtbP41155 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LtbP41155 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LtbP41155 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms