Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VhlP40338 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VhlP40338 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VhlP40338 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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