Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TtlP38585 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TtlP38585 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TtlP38585 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TtlP38585 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TtlP38585 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TtlP38585 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TtlP38585 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms