Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms