Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LdlrP35951 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms