Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2aP35436 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms