Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptk2P34152 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms