Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pola2P33611 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pola2P33611 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pola2P33611 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms