Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim2P33610 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim2P33610 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim2P33610 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim2P33610 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prim2P33610 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim2P33610 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim2P33610 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms