Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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