Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn10P28658 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn10P28658 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn10P28658 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms