Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms