Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vav1P27870 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms