Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Xrcc5P27641 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc5P27641 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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