Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfraP26618 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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