Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PparaP23204 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PparaP23204 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms