Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RarbP22605 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms