Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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