Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms