Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxb1P17919 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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