Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms