Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp53P15975 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp53P15975 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp53P15975 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp53P15975 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp53P15975 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms