Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rag1P15919 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rag1P15919 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rag1P15919 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rag1P15919 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms