Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30aP15533 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms